MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011988	GTG	2	6	91697	91702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106209
1502	NC_011988	CCCT	2	8	91785	91792	0 %	25 %	0 %	75 %	222106209
1503	NC_011988	TCA	2	6	91829	91834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106209
1504	NC_011988	CCTGAC	2	12	91893	91904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222106209
1505	NC_011988	TGC	2	6	91905	91910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106209
1506	NC_011988	GGA	2	6	91966	91971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106209
1507	NC_011988	CCG	2	6	92390	92395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106210
1508	NC_011988	TCT	2	6	92399	92404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106210
1509	NC_011988	GCA	2	6	92457	92462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106210
1510	NC_011988	GC	3	6	92520	92525	0 %	0 %	50 %	50 %	222106210
1511	NC_011988	A	6	6	92597	92602	100 %	0 %	0 %	0 %	222106210
1512	NC_011988	CGG	2	6	92652	92657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106210
1513	NC_011988	CATG	2	8	92684	92691	25 %	25 %	25 %	25 %	222106210
1514	NC_011988	CGA	2	6	92696	92701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106210
1515	NC_011988	GCAG	2	8	92750	92757	25 %	0 %	50 %	25 %	222106210
1516	NC_011988	ATG	2	6	92770	92775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106210
1517	NC_011988	TCC	2	6	92814	92819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106210
1518	NC_011988	GCG	2	6	92941	92946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106210
1519	NC_011988	GC	4	8	93016	93023	0 %	0 %	50 %	50 %	222106211
1520	NC_011988	TCGA	2	8	93026	93033	25 %	25 %	25 %	25 %	222106211
1521	NC_011988	GCT	2	6	93050	93055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106211
1522	NC_011988	TGA	2	6	93105	93110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106211
1523	NC_011988	ATC	2	6	93137	93142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106211
1524	NC_011988	GGT	2	6	93188	93193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106211
1525	NC_011988	CA	3	6	93234	93239	50 %	0 %	0 %	50 %	222106211
1526	NC_011988	CGC	2	6	93248	93253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106211
1527	NC_011988	TGT	2	6	93264	93269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106211
1528	NC_011988	CAA	2	6	93382	93387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106211
1529	NC_011988	GCT	2	6	93405	93410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106211
1530	NC_011988	TGG	2	6	93418	93423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106211
1531	NC_011988	GCC	2	6	93546	93551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106211
1532	NC_011988	GA	3	6	93588	93593	50 %	0 %	50 %	0 %	222106211
1533	NC_011988	GCG	2	6	93621	93626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106211
1534	NC_011988	CCA	2	6	93650	93655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106211
1535	NC_011988	CGG	2	6	93661	93666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106211
1536	NC_011988	CGG	2	6	93769	93774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106211
1537	NC_011988	GCG	2	6	93839	93844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106211
1538	NC_011988	CAA	2	6	93969	93974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106212
1539	NC_011988	CCAAT	2	10	93975	93984	40 %	20 %	0 %	40 %	222106212
1540	NC_011988	GTC	2	6	93998	94003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106212
1541	NC_011988	CCGG	2	8	94044	94051	0 %	0 %	50 %	50 %	222106212
1542	NC_011988	ATC	2	6	94272	94277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106212
1543	NC_011988	CGT	2	6	94288	94293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106212
1544	NC_011988	GCT	2	6	94322	94327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106212
1545	NC_011988	GAG	2	6	94355	94360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106212
1546	NC_011988	GCG	2	6	94382	94387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106212
1547	NC_011988	GA	3	6	94389	94394	50 %	0 %	50 %	0 %	222106212
1548	NC_011988	GAT	2	6	94409	94414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106212
1549	NC_011988	ACG	2	6	94493	94498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106212
1550	NC_011988	GAT	2	6	94516	94521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106212
1551	NC_011988	CGC	2	6	94540	94545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106212
1552	NC_011988	CCAG	2	8	94578	94585	25 %	0 %	25 %	50 %	222106212
1553	NC_011988	TGG	2	6	94595	94600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106212
1554	NC_011988	CGG	3	9	94666	94674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106212
1555	NC_011988	CGG	2	6	94678	94683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106212
1556	NC_011988	GCC	2	6	94715	94720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106212
1557	NC_011988	GCG	2	6	94733	94738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106212
1558	NC_011988	ACC	2	6	94787	94792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106212
1559	NC_011988	TCAA	2	8	94911	94918	50 %	25 %	0 %	25 %	222106212
1560	NC_011988	CTT	2	6	94925	94930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106212
1561	NC_011988	GC	3	6	94999	95004	0 %	0 %	50 %	50 %	222106212
1562	NC_011988	TTGG	2	8	95187	95194	0 %	50 %	50 %	0 %	222106212
1563	NC_011988	GCAG	2	8	95220	95227	25 %	0 %	50 %	25 %	222106212
1564	NC_011988	CGC	3	9	95254	95262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106212
1565	NC_011988	ACA	2	6	95271	95276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106212
1566	NC_011988	TCCT	2	8	95280	95287	0 %	50 %	0 %	50 %	222106212
1567	NC_011988	GTT	2	6	95321	95326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106212
1568	NC_011988	ATC	2	6	95372	95377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106212
1569	NC_011988	CCG	2	6	95385	95390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106212
1570	NC_011988	ATG	2	6	95396	95401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106212
1571	NC_011988	CGG	2	6	95457	95462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106212
1572	NC_011988	TGG	2	6	95467	95472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106212
1573	NC_011988	GAT	2	6	95564	95569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106212
1574	NC_011988	GTC	2	6	95588	95593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106212
1575	NC_011988	CGGT	2	8	95606	95613	0 %	25 %	50 %	25 %	222106212
1576	NC_011988	GC	3	6	95813	95818	0 %	0 %	50 %	50 %	222106212
1577	NC_011988	GAA	2	6	95867	95872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106212
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1579	NC_011988	AGG	2	6	95958	95963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106212
1580	NC_011988	GTG	2	6	96036	96041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106212
1581	NC_011988	TGA	2	6	96489	96494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106213
1582	NC_011988	AGGCGC	2	12	96561	96572	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222106213
1583	NC_011988	TAT	3	9	96580	96588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106213
1584	NC_011988	ATA	2	6	96623	96628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106213
1585	NC_011988	TAT	2	6	96677	96682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106213
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1588	NC_011988	CCATTA	2	12	96750	96761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106213
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1591	NC_011988	TGCTT	2	10	97012	97021	0 %	60 %	20 %	20 %	222106213
1592	NC_011988	AGG	2	6	97053	97058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106213
1593	NC_011988	GCT	2	6	97234	97239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106213
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1596	NC_011988	ACC	2	6	97412	97417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106213
1597	NC_011988	CAA	2	6	97435	97440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106213
1598	NC_011988	GCG	2	6	97454	97459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106213
1599	NC_011988	GTC	2	6	97469	97474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106213
1600	NC_011988	GTG	2	6	97491	97496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106213
1601	NC_011988	GCG	2	6	97636	97641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106213
1602	NC_011988	GGC	2	6	97759	97764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106213
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1607	NC_011988	GTG	2	6	98009	98014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106213
1608	NC_011988	AG	3	6	98042	98047	50 %	0 %	50 %	0 %	222106213
1609	NC_011988	TTCG	2	8	98103	98110	0 %	50 %	25 %	25 %	222106213
1610	NC_011988	GA	4	8	98146	98153	50 %	0 %	50 %	0 %	222106213
1611	NC_011988	ATGA	2	8	98265	98272	50 %	25 %	25 %	0 %	222106214
1612	NC_011988	CTG	2	6	98295	98300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106214
1613	NC_011988	CG	4	8	98330	98337	0 %	0 %	50 %	50 %	222106214
1614	NC_011988	GCC	2	6	98355	98360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106214
1615	NC_011988	TTCG	2	8	98409	98416	0 %	50 %	25 %	25 %	222106214
1616	NC_011988	GAC	2	6	98438	98443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106214
1617	NC_011988	CCAG	2	8	98471	98478	25 %	0 %	25 %	50 %	222106214
1618	NC_011988	GCGCG	2	10	98499	98508	0 %	0 %	60 %	40 %	222106214
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1621	NC_011988	CT	3	6	98595	98600	0 %	50 %	0 %	50 %	222106214
1622	NC_011988	TTG	2	6	98665	98670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106214
1623	NC_011988	ACG	2	6	98671	98676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106214
1624	NC_011988	GCG	2	6	98750	98755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106214
1625	NC_011988	GCA	2	6	98766	98771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106214
1626	NC_011988	GCAA	2	8	98775	98782	50 %	0 %	25 %	25 %	222106214
1627	NC_011988	TCG	2	6	98785	98790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106214
1628	NC_011988	CGA	2	6	98819	98824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106214
1629	NC_011988	TTGCC	2	10	98825	98834	0 %	40 %	20 %	40 %	222106214
1630	NC_011988	GCG	2	6	98839	98844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106214
1631	NC_011988	CGG	2	6	98850	98855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106214
1632	NC_011988	CGG	2	6	98876	98881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106214
1633	NC_011988	GGC	2	6	98948	98953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106214
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1642	NC_011988	GGC	2	6	99552	99557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106215
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1645	NC_011988	TGG	2	6	99639	99644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106215
1646	NC_011988	CTGG	2	8	99710	99717	0 %	25 %	50 %	25 %	222106215
1647	NC_011988	CAG	2	6	99760	99765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106215
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1649	NC_011988	CGA	2	6	99798	99803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106215
1650	NC_011988	TCA	2	6	99806	99811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106215
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1652	NC_011988	CGT	2	6	99852	99857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106215
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1654	NC_011988	CAT	2	6	99904	99909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106215
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1658	NC_011988	TGC	2	6	100164	100169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106216
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1669	NC_011988	CAGC	2	8	100418	100425	25 %	0 %	25 %	50 %	222106216
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1694	NC_011988	GAT	2	6	101189	101194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106216
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1731	NC_011988	CGA	2	6	103988	103993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106219
1732	NC_011988	CAA	2	6	104084	104089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106219
1733	NC_011988	TTC	2	6	104097	104102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106219
1734	NC_011988	GAT	2	6	104175	104180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106219
1735	NC_011988	TTC	2	6	104182	104187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106219
1736	NC_011988	ATG	2	6	104239	104244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106219
1737	NC_011988	AGC	2	6	104284	104289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106220
1738	NC_011988	TGC	2	6	104369	104374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106220
1739	NC_011988	GC	3	6	104397	104402	0 %	0 %	50 %	50 %	222106220
1740	NC_011988	GAT	2	6	104476	104481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106220
1741	NC_011988	CAG	2	6	104524	104529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106220
1742	NC_011988	CCGC	2	8	104553	104560	0 %	0 %	25 %	75 %	222106220
1743	NC_011988	TTG	2	6	104693	104698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106220
1744	NC_011988	GAA	2	6	104750	104755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106220
1745	NC_011988	ACC	2	6	104771	104776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106220
1746	NC_011988	TGT	2	6	104814	104819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106220
1747	NC_011988	TCA	2	6	104865	104870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106220
1748	NC_011988	GGT	2	6	104893	104898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106220
1749	NC_011988	CCA	2	6	104919	104924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106220
1750	NC_011988	CCA	2	6	105005	105010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106220
1751	NC_011988	AC	3	6	105027	105032	50 %	0 %	0 %	50 %	222106220
1752	NC_011988	TGG	2	6	105054	105059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106220
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1755	NC_011988	GTGTT	2	10	105158	105167	0 %	60 %	40 %	0 %	222106220
1756	NC_011988	ACG	2	6	105218	105223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106220
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1758	NC_011988	GTG	2	6	105323	105328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106220
1759	NC_011988	GTT	2	6	105355	105360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106220
1760	NC_011988	ATG	2	6	105380	105385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106220
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1762	NC_011988	CCG	2	6	105398	105403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106220
1763	NC_011988	CTCCGG	2	12	105436	105447	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222106220
1764	NC_011988	GC	3	6	105478	105483	0 %	0 %	50 %	50 %	222106220
1765	NC_011988	GCTT	2	8	105488	105495	0 %	50 %	25 %	25 %	222106220
1766	NC_011988	GCT	2	6	105496	105501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106220
1767	NC_011988	TG	3	6	105536	105541	0 %	50 %	50 %	0 %	222106220
1768	NC_011988	GAGC	2	8	105562	105569	25 %	0 %	50 %	25 %	222106220
1769	NC_011988	ATC	2	6	105587	105592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106220
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1771	NC_011988	ATG	2	6	105710	105715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106220
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1778	NC_011988	CAG	2	6	106144	106149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106221
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1782	NC_011988	CG	3	6	106308	106313	0 %	0 %	50 %	50 %	222106221
1783	NC_011988	TGG	2	6	106371	106376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106221
1784	NC_011988	GCC	2	6	106477	106482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106221
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1821	NC_011988	GAT	2	6	108250	108255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106223
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1838	NC_011988	CG	3	6	109103	109108	0 %	0 %	50 %	50 %	222106223
1839	NC_011988	AAGGC	2	10	109112	109121	40 %	0 %	40 %	20 %	222106223
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1842	NC_011988	GCG	2	6	109315	109320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106223
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1853	NC_011988	ATG	2	6	110237	110242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106223
1854	NC_011988	TCA	2	6	110399	110404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106224
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1858	NC_011988	CCA	2	6	110580	110585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106224
1859	NC_011988	GCA	2	6	110595	110600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106224
1860	NC_011988	AGA	2	6	110612	110617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106224
1861	NC_011988	GGA	2	6	110668	110673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106224
1862	NC_011988	ACCGA	2	10	110728	110737	40 %	0 %	20 %	40 %	222106224
1863	NC_011988	AAT	2	6	110758	110763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106224
1864	NC_011988	TGA	2	6	110784	110789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106224
1865	NC_011988	TGGC	2	8	110855	110862	0 %	25 %	50 %	25 %	222106224
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1867	NC_011988	CTG	2	6	111127	111132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106224
1868	NC_011988	TCTGC	2	10	111285	111294	0 %	40 %	20 %	40 %	222106224
1869	NC_011988	TGC	2	6	111299	111304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106224
1870	NC_011988	CGC	2	6	111349	111354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106224
1871	NC_011988	GCC	2	6	111475	111480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106224
1872	NC_011988	ATC	2	6	111538	111543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106224
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1877	NC_011988	GCTG	2	8	111699	111706	0 %	25 %	50 %	25 %	222106224
1878	NC_011988	GAT	2	6	111799	111804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106224
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1893	NC_011988	CTG	2	6	112748	112753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106225
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1895	NC_011988	CGA	2	6	112788	112793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106225
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1983	NC_011988	GA	3	6	117822	117827	50 %	0 %	50 %	0 %	222106231
1984	NC_011988	GGCA	2	8	117835	117842	25 %	0 %	50 %	25 %	222106231
1985	NC_011988	CTGC	2	8	117903	117910	0 %	25 %	25 %	50 %	222106231
1986	NC_011988	AAGG	2	8	117965	117972	50 %	0 %	50 %	0 %	222106231
1987	NC_011988	GGC	2	6	118059	118064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106231
1988	NC_011988	GC	4	8	118063	118070	0 %	0 %	50 %	50 %	222106231
1989	NC_011988	GGC	2	6	118084	118089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106231
1990	NC_011988	TTC	2	6	118094	118099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106231
1991	NC_011988	TCA	2	6	118114	118119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106231
1992	NC_011988	GCA	2	6	118202	118207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106232
1993	NC_011988	GGC	2	6	118250	118255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106232
1994	NC_011988	GGC	2	6	118261	118266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106232
1995	NC_011988	CT	3	6	118333	118338	0 %	50 %	0 %	50 %	222106232
1996	NC_011988	ATC	2	6	118364	118369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106232
1997	NC_011988	CA	3	6	118389	118394	50 %	0 %	0 %	50 %	222106232
1998	NC_011988	CCGC	2	8	118403	118410	0 %	0 %	25 %	75 %	222106232
1999	NC_011988	CGC	2	6	118438	118443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106232
2000	NC_011988	CAG	3	9	118444	118452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106232

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